Au XIXe siècle, les maladies contagieuses sont responsables d’une très forte mortalité chez les enfants en bas âge de Québec. Afin de protéger la population, des hôpitaux d’isolement permettent de garder temporairement à l’écart les personnes atteintes. Dans un premier temps, ils sont ouverts uniquement pour la durée d’une épidémie. C'est le cas, par exemple, de l'hôpital Près-de-ville.
Des établissements permanents seront créés aussi. À partir de 1832, un hôpital de quarantaine est installé à la Grosse-Île en aval de Québec pour les passagers et l'équipage des bateaux arrivant d’autres pays. On trouvera l'information sur cet établissement dans la section relative aux hôpitaux pour immigrants et marins.
Un hôpital d’isolement pour la population locale (l’hôpital « civique ») est créé à la fin du XIXe siècle. Au XXe, s’ajoutent l'Hôpital Laval spécialisé dans les soins aux tuberculeux, et le camp Taschereau destiné aux enfants de tuberculeux.
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